Markdown é uma sintaxe para redação em geral que aplicar formatação ao texto através de texto puro de forma que as marcações de formato sejam intuitivamente conexas ao efeito.
Tem sido utilizada com a intenção reduzir a obsolescência tecnológica, visto que o texto fonte fica armazenado texto puro, podendo ser ASCII ou UTF, sem códigos proprietários, de forma que o original possa ser prontamente lido sem necessidade de aplicativos especiais.
Tem sido recomendada também como uma forma de evitar distrações com as complexas interfaces de aplicativos modernas (distraction free).
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A primeira publicação foi feita online por John Gruber.  É conhecida como Markdown Básico. Não inclui sublinhado, riscado ou tabelas.
Existem vários esforços em padronizar a sintaxe. São conhecidas como Markdown Flavors (sabores):

• CommonMark: Especificação completa com o objetivo de padronizar a Markdown básica e eliminar as ambiguidades das implementações. Tem as particularidades de filtrar tags HTML e produzir links automaticamente.
• GitHub Flavored Markdown (GFM): Estende a CommonMark com tabelas, lista de tarefas, riscado, entre outros. 
• MultiMarkdown: Adiciona ao básico, tabelas, notas de rodapé, citações e bibliografia, equações matemáticas, lista de definições, referências cruzadas e outros recursos.
• Markdown Extra: Adiciona ao básico, tabelas, notas de rodapé, lista de definições, abreviações e HTML.
• Pandoc Markdown: Implementação feita para a interface Pandoc que inclui tabelas, equações matemáticas, citações e bibliografia, referências cruzadas, notas de rodapé, sobrescrito e subscrito, riscado, metadados, etc.

Por estar disponível apenas comercialmente, destaco o programa Scrivener. Possui recursos diferenciados com o objetivo de otimizar a produção literária mas também tem sido utilizado por escritores acadêmicos. Suporta MultiMarkdown, mas pode ser integrado ao Pandoc utilizando Scrivomatic com a opção de configurá-lo pelo Pandocomatic.

Mendeley e Readcube são dois aplicativos Windows gratuitos para gerenciamento, geração e organização de citações. Seu uso é facilitado pelas extensões para o navegador Chrome Mendeley Importer e Readcube Web Importer.

​Ambos permitem:

1. Salvar dados estruturados de artigos, livros, sites, congressos ou revistas a serem citados.
2. Gerar automaticamente formatos padronizados de citação conforme configuração (ex. APA, ABNT, Chicago).
3. Organizar os dados de citação em pastas e etiquetas (tags).
4. Organizar os arquivos acumulados em pastas e etiquetas (tags).
5. Fazer anotações e realces (highlights) diretamente nos arquivos armazenados.
6. Identificar automaticamente os dados bibliográficos de um arquivo importado localmente ou de um site através de suas extensões.

Aqui vão algumas dicas retiradas da ajuda Proquest:

TI(plataforma recursos humanos)
Retorna resultados com todas as palavras no Título

AB( recursos humanos  OR  gestão de pessoas)
Retorna resultados com todas as palavras "recursos humanos" OU com "gestão pessoas" no Abstract, em qualquer ordem em cada conjunto

AU(smith)  NOT  TI(money)
Retorna resultados contendo entre os autores smith e desde que não exista a palavra money no Título

TI(educação adultos)  AND  AB(superior NEAR qualidade)
Retorna resultados contendo nos Títulos as palavras educação E adultos em qualquer ordem E com Abstracts onde a palavras superior venha próxima de qualidade, em qualquer ordem, espaçadas no máximo por 4 intermediárias

AB,TI(educação PRE superior)
Retorna resultados onde a palavra educação Preceda à superior, separadas no máximo por 4 intermediárias, e que apareçam no Abstract OU no Título

NOFT(educação PRE/2 adultos)
Retorna resultados onde a palavra educação Preceda à superior, espaçadas por no máximo 2 intermediárias, em todos os campos de pesquisa, exceto no texto principal (no full text).

educação PRE/1 adultos AND YR(>=2012)
Retorna resultados onde a palavra educação Preceda à adultos, espaçadas por no máximo 1 intermediária, em todos os campos de pesquisa, E cujo ano seja posterior a 2012, inclusive.

AU(sm?th)  AND SU(higher education)
Retorna autores que podem estar escritos como smith ou smyth ou smoth, etc, E cujo Subject ou assunto contenha "higher education" em qualquer ordem

TI(fazend*) AND SU.EXACT("higher education")
Retorna Títulos que contenha quaisquer palavras que comecem com fazend, como fazenda, fazendas, fazendeiros E que o Subject seja exatamente e tão somente "higher education")

Eis uma alternativa. Com legendas em inglês.​
Fonte: Harvard Business Review